MBV3070 – Bioinformatikk
Timeplan, pensum og eksamensdato
Kort om emnet
Biologiske sekvensdatabaser. Parvise sekvenssammenstillinger, flersekvenssammenstillinger, analyse av genomiske DNA-sekvenser, proteinmodellering, gene ontology, RNA-sekvensering, enkel innf?ring i programmering.
Hva l?rer du?
Forst?else av hvordan sammenligning av biologiske sekvenser kan gi informasjon om funksjon og evolusjon av sekvensene. Virkem?ten til algoritmer for optimale parvise sekvenssammenstillinger og for s?k i sekvensdatabasene. Kjennskap til verkt?y for homologibasert modellering av tredimensjonelle proteinstrukturer. Prinsipper for RNA-sekvensering og analyse av resultatene fra slike. Kjennskap til hvordan bioinformatiske verkt?y kan modifiseres eller kobles sammen ved bruk av enkel programmering.
Opptak og adgangsregulering
Studenter m? hvert semester s?ke og f? plass p? undervisningen og melde seg til eksamen i Studentweb.
Dersom du ikke allerede har studieplass ved UiO, kan du s?ke opptak til v?re studieprogrammer, eller s?ke om ? bli enkeltemnestudent.
Forkunnskaper
Obligatoriske forkunnskaper
I tillegg til generell studiekompetanse eller realkompetanse m? du dekke spesielle opptakskrav.
Du m? ha:
- Matematikk R1 (eller Matematikk S1 og S2) + R2
Og en av disse:
- Fysikk (1+2)
- Kjemi (1+2)
- Biologi (1+2)
- Informasjonsteknologi (1+2)
- Geofag (1+2)
- Teknologi og forskningsl?re (1+2)
De spesielle opptakskravene kan ogs? dekkes med fag fra videreg?ende oppl?ring f?r Kunnskapsl?ftet, eller p? andre m?ter.
MBV2010 – Molekyl?rbiologi (videref?rt) eller tilsvarende. (MBV 2010 vil v?re obligatorisk forkunnskap fra 2008.)
Anbefalte forkunnskaper
MBV1050 - Biokjemi I - Biomolekylers struktur og funksjon, MAT1001 - Matematikk 1. MBV2010 – Molekyl?rbiologi (videref?rt) (obligatorisk forkunnskap fom v?ren 2008).
Overlappende emner
8 studiepoeng overlapp mot BIOS3010 – Bioinformatikk
Emnet kan overlappe med emner som har v?rt undervist 2003 v?r og tidligere.
Undervisning
Emnet vil strekke seg over et helt semester. Forelesninger 34 timer, arbeid p? PC-stue dr?yt 60 timer.
Eksamen
En skriftlig avsluttende 3 timers eksamen.
Hjelpemidler
Ingen hjelpemidler er tillatt.
Karakterskala
Emnet bruker karakterskala fra A til F, der A er beste karakter og F er stryk. Les mer om karakterskalaen.
Begrunnelse og klage
Adgang til ny eller utsatt eksamen
Dette emnet tilbyr b?de utsatt og ny eksamen. Les mer:
Evaluering av emnet
Vi gjennomf?rer fortl?pende evaluering av emnet, og med jevne mellomrom ber vi studentene delta i en mer omfattende evaluering.