BIOS3010 – Bioinformatikk
Beskrivelse av emnet
Kort om emnet
Dagens molekyl?rbiologiske metoder produserer datamengder som krever spesielle beregningsverkt?y for ? kunne forst?s og analyseres. Disse gj?r det mulig ? angripe problemer innen livsvitenskapene som inntil nylig ble ansett som ul?selige. I dette emnet l?rer du om sentrale temaer, teorier og verkt?y i bioinformatikk, samt ? bruke disse til ? sammenlikne og analysere biologiske datasett.
Hva l?rer du?
Etter ? ha tatt dette emnet
- kan du sammenlikne sekvenser av nukleotider og aminosyrer for ? gi funksjonell og evolusjon?r informasjon
- kan du analysere og visualisere proteinstrukturer
- kan du bruke enkel programmering til ? implementere algoritmer relevant for bioinformatikk
- kan du gj?re enkle analyser av datasett fra dypsekvenseringsteknologier
- kan du diskutere og vurdere bruken av metoder for sekvens- og strukturanalyse
- kan du gj?re rede for de teoretiske og statistiske prinsippene som ligger til grunn for sekvens- og strukturanalyse
Opptak til emnet
Studenter m? hvert semester?s?ke og f? plass p? undervisningen og melde seg til eksamen?i Studentweb.
Prioritet vil bli gitt til studenter p? bachelorprogrammet i biovitenskap.
Spesielle opptakskrav
I tillegg til generell studiekompetanse eller realkompetanse m? du dekke spesielle opptakskrav.
Du m? ha:
- Matematikk R1 (eller Matematikk S1 + S2)
Og en av disse:
- Matematikk R2
- Fysikk (1+2)
- Kjemi (1+2)
- Biologi (1+2)
- Informasjonsteknologi (1+2)
- Geofag (1+2)
- Teknologi og forskingsl?re (1+2)
Matematikk R2 var et krav til og med studie?ret 2021/2022 som del av en fors?ksordning. Fra og med studie?ret 2022/2023 er det ikke lenger et krav med matematikk R2.
De spesielle opptakskravene kan ogs? dekkes med fag fra videreg?ende oppl?ring f?r Kunnskapsl?ftet, eller p? andre m?ter. Les mer om spesielle opptakskrav.
Obligatoriske forkunnskaper
Element?re forkunnskaper i programmering, tilsvarende innholdet i BIOS1100 – Innf?ring i beregningsmodeller for biovitenskap.
Anbefalte forkunnskaper
BIOS1110 – Celle- og molekyl?rbiologi og STK1000 – Innf?ring i anvendt statistikk
Overlappende emner
- 8 studiepoeng overlapp med MBV3070 – Bioinformatikk (nedlagt).
- 6 studiepoeng overlapp med IN4030 – Introduksjon til bioinformatikk.
Undervisning
- Forelesninger
- Organisert ?ving i gruppe med hjelpel?rer (Obligatorisk de f?rste fire ukene)
- Selvstendig gruppearbeid med obligatoriske innleveringer der en hjelpel?rer er tilgjengelig (Obligatorisk oppm?te de f?rste fire ukene).
Det er obligatorisk oppm?te til f?rste forelesning for studenter som skal f?lge undervisning i emnet. Dette gjelder?ogs? for studenter p? venteliste. Du mister plassen p? emnet dersom?forfall til f?rste forelesning ikke er meldt til studieseksjonen studieinfo@ibv.uio.no, f?r forelesningen starter.
Godkjente obligatoriske elementer er gyldige i 3 ?r.
Adgang til undervisning: Dersom du har?gjennomf?rt og f?tt godkjent obligatorisk undervisning, har du ikke krav p? ny undervisning. Dersom du har f?tt undervisningsopptak til emnet, men ikke har gjennomf?rt eller f?tt godkjent obligatorisk undervisning, har du?rett til ny undervisning n?r det er ledig?kapasitet.
Eksamen
- Avsluttende skriftlig eksamen som teller 100% ved sensurering.
Obligatoriske oppgaver m? v?re godkjent og obligatoriske oppm?ter m? v?re gjennomf?rte for ? kunne g? opp til eksamen.
Godkjente obligatoriske elementer er gyldige i 3 ?r.
Eksamensfors?k: Som eksamensfors?k i dette emnet teller ogs? fors?k i f?lgende tilsvarende emne: MBV3070 – Bioinformatikk (nedlagt)
Hjelpemidler til eksamen
Ingen hjelpemidler er tillatt.
Eksamensspr?k
Du kan besvare eksamen p? norsk, svensk, dansk eller engelsk.
Karakterskala
Emnet bruker karakterskala fra A til F, der A er beste karakter og F er stryk. Les mer om karakterskalaen.
Adgang til ny eller utsatt eksamen
Dette emnet tilbyr b?de utsatt og ny eksamen. Les mer:
Mer om eksamen ved UiO
- Kildebruk og referanser
- Tilrettelegging p? eksamen
- Trekk fra eksamen
- Syk p? eksamen / utsatt eksamen
- Begrunnelse og klage
- Ta eksamen p? nytt
- Fusk/fors?k p? fusk
Andre veiledninger og ressurser finner du p? fellessiden om eksamen ved UiO.