English version of this page

HPC/tungregning, databehandling og analyse med Colossus i TSD

Colossus er HPC-klyngen i TSD og tilbys av UiO i 澳门葡京手机版app下载 med Sigma2. Colossus-tilgang er en tjeneste p? foresp?rsel og vil gi deg tilgang til en liten UiO-allokering som standard. Vi anbefaler sterkt at du benytter de mye st?rre Sigma2 HPC-ressursene p? Colossus, dette f?r du til ved ? sende en s?knad til Sigma2.

N?kkeltall

Colossus er en klynge designet for ? h?ndtere flere samtidige jobber og im?tekomme brukere med forskjellige krav. Klyngeprofilen er for parallelle applikasjoner med h?ye minne- og/eller IO-krav. Colossus best?r av 57 beregningsnoder, 4 noder med mye minne, 6 GPU-akselererte noder og 2 FPGA-akselererte bioinformatikknoder som kj?rer CentOS 7. Nodene er koblet sammen via Infiniband-interconnect til et 3PB+ IBM ESS GPFS-filsystem.

Tildelinger

Ressursene er delt p? 3 allokeringer og tilgang avhenger av om kvote/ressurser er tildelt prosjektet:

  • Sigma2-tildeling: tilgjengelig for prosjekter som har bedt om og mottatt kvote fra Sigma2
  • TSD/UiO-allokering: tilgjengelig for alle TSD-prosjekter med HPC-tilgang
  • Dedikerte ressurser: flere prosjekter har anskaffet en eller flere noder for eksklusiv tilgang

Ressurser per tildeling

F?lgende ressurser er tilgjengelige per tildeling:

Allokering Node type Allokerbare enheter: tilgjengelige ressurser (per node)

Sigma2

(--account=pXX)

24 beregningsnoder

kjerner: 64 (2x AMD EPYC 7551/7452 32-kjerner prosessorer)

minne: 503 GiB

 

2 GPU aksellererte noder

(--partition=accel)

kjerner: 96 (2x AMD EPYC 7642 48-kjerner prosessorer)

minne: 982 GiB

gpu: 4 (Nvidia Tesla A100 40GB)

 

4 bigmem noder

(--partition=bigmem)

kjerner: 128 (2x AMD AMD EPYC 7702 64-kjerner prosessorer)

minne: 3955 GiB

lokal scratch: 7 TiB NVMe disk

NOTE: Sigma2 har allokert disse til en dedikert ressurs fra 230710 til 231001.

TSD/UiO

(--account=pXX_tsd)

5 beregningsnoder

kjerner: 64 (2x AMD EPYC 7551 32-kjerner prosessorer)

minne: 503 GiB

 

2 GPU aksellererte noder

(--partition=accel)

kjerner: 64 (2x AMD EPYC 7551 32-kjerner prosessorer)

minne: 503 GiB

gpu: 2 (Nvidia Tesla V100 32GB)

Dedikerte ressurser

(--account=pXX_reservation)

28 beregningsnoder

kjerner: 64 (2x AMD EPYC 7551/7452 32-kjerner prosessorer)

minne: 503 GiB

 

2 GPU aksellererte noder

(--partition=accel)

kjerner: 64/96 (2x AMD EPYC 7551 32-kjerner/7552 48-kjerner prosessorer)

minne: 503 GiB

gpus: 2 (Nvidia Tesla V100 32GB)

 

2 FPGA aksellererte Dragen
bioinformatikk noder

(--account=pXX_dragen)

kjerner: 24 (2x Intel Xeon Gold 6226 12-kjerner prosessorer)

minne: 250 GiB

Illumina Dragen programvare

Administrer Colossus Ressurser

Hvordan f? ressurser p? Colossus og priser.

Bruk av Colossus

Hvordan begynne ? bruke HPC Colossus-ressurser.

S?k i veiledningene

S?k i veiledningene
Kontakt brukerst?tte:

Ring oss

Vi har ?pent mellom 08:30 og 17:00 p? hverdager,
og mellom 10:00 og 15:00 p? l?rdager.

Telefonnummer: 22 84 00 04

Send inn sak til oss

Du kan sende inn din foresp?rsel via e-post til: it-support@uio.no.

G? til e-post

Book et videom?te over Zoom

Er du student eller ansatt kan du avtale veiledningstime hos UiO Helpdesk over Zoom. Tilgjengelige tider er tirsdag til torsdag mellom 11:00 og 13:00.

Book et videom?te

Chat med oss

V?r chat er bemannet mellom 09:00 og 16:00 p? hverdager.

?pne chat