IN4030 – Introduksjon til bioinformatikk
Beskrivelse av emnet
Kort om emnet
Dette emnet gir en innf?ring i sentrale begreper og metoder innen?bioinformatikk. Det legges vekt p? gjennomgang av?effektive algoritmer, datastrukturer og teknikker som benyttes i aktuelle programmer for analyse av DNA-, RNA- og proteinsekvenser. N?dvendig element?r kunnskap i molekyl?rbiologi vil bli formidlet underveis. Temaer som omfattes inkluderer sammenligning og sammenstilling av to eller flere sekvenser, indeksering av og s?king i?sekvensdatabaser, m?nsteroppdaging, s?king med sekvensm?nstre og profiler, genprediksjon, klustring og fylogenetikk, samt mapping og sammensetning av?data fra genomsekvensering.
Hva l?rer du?
Etter ? ha tatt IN4030:
- forst?r du grunnleggende begreper i bioinformatikk
- har du oversikt over noen av de viktigste metodene og verkt?yene som benyttes
- forst?r du hvordan noen av de grunnleggende metodene for analyse av biologiske sekvenser fungerer
- forst?r du behovet for at metodene er n?yaktige og effektive
- kan du implementere noen av algoritmene
- kan du utf?re enkle sekvensanalyser ved ? anvende eksisterende verkt?y
Opptak til emnet
Studenter m? hvert semester?s?ke og f? plass p? undervisningen og melde seg til eksamen?i Studentweb.
Dersom du ikke allerede har studieplass ved UiO, kan du s?ke opptak til v?re?studieprogrammer.
Anbefalte forkunnskaper
IN1000 – Introduksjon til objektorientert programmering/INF1000 – Grunnkurs i objektorientert programmering (videref?rt)/IN1900 – Introduksjon i programmering for naturvitenskapelige anvendelser/INF1100 – Grunnkurs i programmering for naturvitenskapelige anvendelser (videref?rt)
Overlappende emner
- 10 studiepoeng overlapp med INF4350 – Grunnkurs i bioinformatikk (videref?rt).
- 7 studiepoeng overlapp med INF5330 – Bioinformatikk (nedlagt).
- 7 studiepoeng overlapp med INF5340 – Algoritmer i bioinformatikk (nedlagt).
- 7 studiepoeng overlapp med INF2300 – Grunnkurs i bioinformatikk (nedlagt).
- 7 studiepoeng overlapp med INF3350 – Grunnkurs i bioinformatikk (nedlagt).
- 7 studiepoeng overlapp med IN325.
- 6 studiepoeng overlapp med BIOS3010 – Bioinformatikk.
Undervisning
2 timer forelesninger og 2 timer gruppe?velser per uke.
Eksamen
Karakter vil bli gitt p? grunnlag av 2 deleksamener som teller 15% hver, og en avsluttende 4 timers skriftlig digital eksamen som teller 70%.
For ? kunne g? opp til endelig eksamen, m? det leveres besvarelser p? begge de to f?rste deleksamenene, men det kreves ikke at de best?s.
Alle eksamener m? gjennomf?res i samme semester.
?
Som eksamensfors?k i dette emnet teller ogs? fors?k i f?lgende tilsvarende emner:?INF4350 - Introductory Course in Bioinformatics,?INF5330 - Bioinformatikk (discontinued),?INF5340 - Algorithms in bioinformatics (discontinued),?INF2300 - Grunnkurs i bioinformatikk (discontinued),?INF3350 - Grunnkurs i bioinformatikk (discontinued). Listen er ikke utt?mmende.
Karakterskala
Emnet bruker?karakterskala fra A til F, der A er beste karakter og F er stryk. Les mer om?karakterskalaen.
Mer om eksamen ved UiO
- Kildebruk og referanser
- Tilrettelegging p? eksamen
- Trekk fra eksamen
- Syk p? eksamen / utsatt eksamen
- Begrunnelse og klage
- Ta eksamen p? nytt
- Fusk/fors?k p? fusk
Andre veiledninger og ressurser finner du p? fellessiden om eksamen ved UiO.