Jan Skov Pedersen har en BSc-grad i fysikk og matematikk fra K?benhavns Universitet i 1983, en MSc-grad i fysikk i 1985, og en PhD i 1988 fra samme universitet.
Han jobbet fra 1988 til 2000 som seniorforsker ved Ris? National Laboratory, og ble professor ved Aarhus Universitet i 2000 i fysikalsk kjemi. Hans forskningsomr?de inkluderer komplekse selv-assosierende systemer, makromolekyl?re komplekser, kolloider, polymerer samt biokjemi og nanovitenskap.
Skov Pedersen er en sann pioner innen bruk av spredningsmetoder basert p? r?ntgenstr?ler og n?ytroner, spesielt sm?vink