Hvordan p?virkes genomst?rrelse og cellest?rrelse av temperatur?

St?rrelsen p? genomet (den totale mengden DNA per celle) varierer enormt b?de hos planter og dyr, og kan vise stor variasjon selv hos n?rst?ende arter. Det finnes ingen entydig forklaring p? dette, men genomst?rrelsen henger tett sammen med cellest?rrelse, av og til kroppsst?rrelse, og med vekstrate og metabolsime. Det er alts? et fundamentalt karaktertrekk ved organismer, og mye tyder p? at det kan p?virkes av temperatur og n?ringstilgang b?de som en fenotypisk og en genotypisk respons. Slike endringer kan ogs? v?re en vei til rask artsdannelse.

Daphnia with eggs

 

 

Det kan tilbys tre masteroppgaver her, og det er tre typer modellorganismer som prim?rt er aktuelle: Fisk (r?ye, stingsild eller sebrafisk), Daphnia og planktonalger (flere arter kan v?re aktuelle). Oppgavene vil g? ut p? ? la organismene vokse ved ulik temperatur og/eller ulik n?ringskonsentrasjon (Daphnia eller alger), og s? m?le cellest?rrelse, genomst?rrelse, vekstrate og evt sekvensering.  Oppgavene kan alts? ha enten et ?kologisk, evolusjon?rt eller molekyl?rt tyngdepunkt, men disse henger naturlig sammen.

 

Utgangspunktet for arbeidet er det NFR-finansierte prosjektet "Genome size, cell size and growth; searching for the causal links (GENOME)" som ble p?begynt v?ren 2010. Prosjektet tar utgangspunkt i en hypotese om at reduksjon i genomst?rrelse er relatert til vekstrate og et behov for reallokering av fosfor fra DNA til RNA for ? maksimere proteinsyntese og vekstrate hos organismer, men det vil ogs? inkludere problemstillinger relatert til ploidiniv?, og hvordan fosfor, temperatur, genomst?rrelse og ploidiniv? p?virker hverandre - og hvilke evolusjon?re konsekvenser dette vil ha. For ? belyse dette vil det prosjektet arbeide med ulike modellorganismer med ulike karakteristika som Daphnia (krepsdyr), fisk (ulike arter) og alger (flere arter). Arbeidet vil foreg? i 澳门葡京手机版app下载 b?de med et internasjonalt prosjektkonsortiet, samt forskere ved CEES og andre forskere ved Biologisk institutt og IMBV. Metodikken er innarbeidet, og oppgavene vil utf?res i et team med oppl?ring i analysemetoder som flowcytometri.

Tags: genom, organisme, ?kologi, Evolusjon
Published Apr. 19, 2018 8:14 AM - Last modified July 16, 2018 12:56 PM

Supervisor(s)

Scope (credits)

60